Domácí spolupráce
SRŠ Vodňany spolupracuje s řadou podniků a institucí v celé ČR:
- Rybářské sdružení ČR České Budějovice – spolupráce při zajišťování odborných exkurzí, při výstavách a akcích zaměřených zejména na propagaci rybářství, chovu ryb a propagaci konzumace sladkovodních ryb.
- FROV - VÚRH Vodňany – zajišťování odborných přednášek a instruktáží pro žáky školy, praxe žáků v rybí líhni.
- Český rybářský svaz, rada ČRS Praha – vydávání propagačních materiálů, publikační činnost, výstavy.
- Český rybářský svaz, územní svazy - pořádání kurzů pro rybářské hospodáře, produkce násadových ryb pro zarybňování rybářských revírů, zejména vzácných druhů ryb (podoustev, mník, jesen, ostroretka aj.).
- Klub ekologické výchovy Praha – škola je jeho členem; odborné akce, konference, studentské práce.
- Krajské školní hospodářství – žákovské praxe
- Rybníkářství Pohořelice, a. s. – praxe žáků ve zpracovně ryb a v rybí líhni
- Klatovské rybářství a. s. - praxe žáků ve zpracovně ryb a na pstruží farmě
- Rybářství Nové Hrady, s. r. o. – praxe žáků na farmě s chovem vodní drůbeže
- Národní park Šumava, Národní park Podyjí – odborné exkurze SRŠ i VOŠ
- CHKO Třeboňsko, CHKO Pálava – odborné exkurze
- Podniky Povodí s. p. – odborné exkurze, praxe studentů VOŠ
- AOPK Praha – kurzy pro elektrolov
- Hydrobiologický ústav ČB - odborné přednášky a praxe
- Rybářství Třeboň a. s., Rybářství Hluboká a.s., Blatenská ryba, spol. s r. o. – praxe při výlovu rybníka, odborná exkurze
- České rybářství s. r. o., Mariánské Lázně – praxe žáků
- Rybářství Hodonín, s. r. o., Rybí líheň, spol. s. r. o., Třebíč, Kinského rybářství s. r. o., Žďár n. Sázavou – odborné exkurze
- Muzeum Ohrada, Hluboká n. Vlt., - determinace vodních živočichů
- Asociace biobazénů a jezírek
Zahraniční spolupráce
Zespól Szkól Sierakow (Polsko) – od roku 1992.
Podstatou spolupráce je vzájemná výměna malých skupin studentů SRŠ, případně pedagogických pracovníků obou škol. Praxe žáků z polské školy u nás je zaměřena na podzimní výlovy, praxe našich žáků je zaměřena na jezerní rybářství – odlovy ryb do vězenců, ténat, tralů apod. Součástí výměny je i poznávací turistika – Poznaň, Štětín, Balt.